抗体设计
抗体设计是蛋白质设计最具临床价值的落地方向之一,核心在于优化互补决定区 (CDR)以提升亲和力、特异性与可开发性。
抗体基本结构
典型 IgG 由两条重链、两条轻链组成,抗原结合位于轻重链各三个 CDR 环 (重链 CDR-H1/H2/H3,轻链 CDR-L1/L2/L3)。其中 CDR-H3 最长、最具多样性。
设计流程
- 模板骨架:选取人源框架(如 VH3 家族)降低免疫原性。
- CDR 建模:用 RFdiffusion/AlphaFold 生成 CDR 环构象。
- 亲和力成熟:对 CDR 做定点或库式突变,筛选高亲和变体。
- 可开发性评估:检查聚集倾向、热稳定性、溶解度。
常见陷阱
- 过度疏水导致聚集与沉淀。
- CDR 过长或构象不稳定,难以表达。
- 忽视人源化,引发抗药物抗体反应。
实践建议:在亲和力与可开发性之间权衡,优先保证表达量与稳定性, 再逐步提升亲和力。